中華菌庫聯盟是一個國內多家菌庫組成的聯盟，聯盟建立旨在保護中國健康人群腸道菌群的多樣性，保障中華民族兒女腸道微生態基因數據的安全性，也為人類遺傳資源的保護作出巨大貢獻，為微生態醫療的產業化提供堅實的基礎。依托微生態醫療產業機構與各級研發平臺，通過校企合作、院企合作、自建菌庫模式，已經完成建設的菌群庫有9個：海峽菌群庫、華南菌群庫、華中菌群庫、中南菌群庫、江西菌群庫、西安菌群庫、蘇州菌群庫、河南菌群庫、河北菌群庫，未來還將在華北、華東、西北、西南地區建設菌庫，共同組建形成“中華菌庫聯盟”，旨在實現3小時內服務每一個客戶。

菌庫聯盟提供最高標準和規范化的菌群提取服務，從健康供體篩選及管理、菌群標準化分離、菌群制備、質量控制、供受體配型、安全性分析、菌群移植、有效性評價、不良反應隨訪等多方面構建完善的菌群庫體系。菌庫聯盟集多質量體系融合、產品質控標準統一、后臺系統數據集中管理、產能庫存統一調度等優勢，能夠快速、有效、精準的為患者提供從咨詢——采樣——配型——移植——隨訪“一站式”服務體驗。

在物流方面，公司與順豐快遞、中集冷云冷鏈公司雙合作模式，采用全過程溫控記錄的方式，確保腸菌產品在運輸過程中質量的穩定的穩定性。訂單通過集中調度分配的形式，確保在移植前第一時間抵達客戶端。

海峽菌群庫、江西菌群庫是目前的菌群樣本庫，是首家獲得科技部人類遺傳資源采集行政許可、科技部人類遺傳資源保藏行政許可的企業，也是國內唯一“六證齊全”的菌群樣本庫，實現安全使用。為科研、醫療、價值轉化等多維度促進我國微生態領域的全面發展，在微生態醫療產業體現“中國智慧”，建立“中國標準”，形成“中國方案”，打造“中國品牌”。